- 1963 - Umřel nám pan Foerster, režie a scénář (FAMU);
- 1965 - Perličky na dně (povídka „Smrt pana Baltazara“), režie, spolupráce na scénáři s B. Hrabalem,
MFF Locarno 1965, Cena FIPRESCI a Zvláštní cena poroty mladých
Zločin v dívčí škole, režie, spolupráce na scénáři s Josefem Škvoreckým - 1966 - Ostře sledované vlaky, režie, spolupráce na scénáři s Bohumilem Hrabalem,
MFF v Mannheimu (1967) Grand Prix
Los Angeles - ocenění v kategorii nejlepšího zahraničního filmu - OSCAR
IFF Addis Abeba – Hlavní cena
Nejúspěšnější film roku v ČSSR
Cena polských kritiků – Varšava
Cena svazu finských filmových kritiků
USA - cena Národní asociace kritiků ( 3. nejlepší film roku 1967)
V roce 2005 byl film zvolen mezi 100. nejlepšími filmy světové kinematografie všech dob – časopisem TIME. - 1967 - Rozmarné léto, režie, spolupráce na scénáři s V. Nývltem,
MFF Karlovy Vary – Grand Prix (1968)
FFM Trutnov – Velké zlaté slunce
Finále Plzeň – Nejlepší film roku 1968 - 1968 - Zločin v šantánu, režie, spolupráce na scénáři s Josefem Škvoreckým
- 1969 - Skřivánci na niti, režie, scénář s B. Hrabalem,
MFF Berlinale- Zlatý medvěd a cena FIPRESCI – 1990
Cena čs. Filmové kritiky - Praha - 1974 - Kdo hledá zlaté dno, režie
- 1976 - Na samotě u lesa, režie
MFF Chicago – Stříbrný Hugo – 1976
MFF San Francisco - Cena O.C.I.C. 1976
MFF Mannheim – Čestné uznání FIPRESCI - 1978 - Báječní muži s klikou, režie, spolupráce na scénáři s Oldřichem Vlčkem
- 1980 - Postřižiny, režie a scénář s B. Hrabalem
MFF Benátky - Zvláštní čestné uznání mezinárodní poroty (1981)
Nové Město n/Metují – Cena filmových kritiků a Cena mladých diváků
MFF Vevey – Zlatá hůlka (1982), Zvláštní uznání poroty a Cena publika
MFF autorského filmu, Belmadena, Španělsko - 2. cena divácké poroty
Cena čs. Filmové kritiky - 1981 - MFF Benátky, Speciální čestné ocenění za film "Postřižiny"
- 1983 - Slavnosti sněženek, režie a scénář s B. Hrabalem
- 1985 - Vesničko má středisková, režie
MFF Montrealu - Zvláštní cena poroty (1986)+ Cena OCIC
MFF Valladoid - Cena diváků (1986)
Los Angeles - Nominace na Oskara (1987)
Nové Město n/Metují - Hrnec smíchu, hlavní cena
MFF Aurilac, Francie - Hlavní cena festivalu
MFF filmových komedií Chamrouse, Francie – Velká cena kritiky
MFF pro mládež - Paříž - cena za herecký výkon J. Bánovi
MFF Prades, Francie – 1. Cena - 1989 - Konec starých časů, režie a spolupráce na scénáři s Jiřím Blažkem
MFF Los Angeles - Cinetex International Comedy - 1990
Cena za nejlepší režii a nejlepší film
MFF Rueil Malmaison, Francie, 1990 - Zlatý orel (Golden Eagle)
MFF Montreal 1989 – Cena za nejlepší režii
MFF Las Vegas, USA – Cena za nejlepší režii
MFF Melbourne – Cena za nejlepší režii MFF Valladoid, Španělsko – cena za kameru - 1990 - Audience, režie
Pro MGM Production natočená inscenace hry V. Havla „AUDIENCE“ a dokumentární film o vzniku této inscenace. - 1991 - Žebrácká opera, režie a scénář s Václavem Havlem
MFF Toronto 1991- Čestný diplom za účast
MFF Chicago 1991- Čestné uznání poroty
Nové Město n/Metují - Cena kritiků - 1994 - Život a neobyčejná dobrodružství vojáka Ivana Čonkina, režie
MFF Benátky 1994 - Zlatá medaile Italského Senátu za film "Život a neobyčejná dobrodružství vojáka Ivana Čonkina"
MFF Vevey 1995 - Zlatý Charlot (cena diváků) a Zvláštní cena poroty mladých - 2001 - Deset minut, režie, scénář
Mezinárodní projekt promítaný pod názvem „Cello“; - 2006 - Obsluhoval jsem anglického krále, režie, scénář
MFF Berlín - Cena filmových kritiků FIPRESCI 2007
Český lev za Nejlepší film roku 2007
Český lev za nejlepší režii J. Menzelovi
Český lev za nejlepší kameru J. Šofrovi
Český lev za nejlepší herecký výkon ve vedlejší roli Martinu Hubovi
Český lev za nejlepší plakát k filmu
MFF Pula – Zvláštní Zlatá aréna za nejlepší režii - 2007 + Cena mladých filmových fanoušků
Nové Město n/Metují - Cena za výtvarný počin Jaromíru Šofrovi
MFF Manaki Brothers ve Skopje – Ex Aequo Zlatá kamera 300 Jaromíru Šofrovi.
1. MFF Durres (Drač), Albánie – 2008, Zlatý gladiátor za nejlepší film festivalu
MFF Peňinsola (Španělsko) - Hlavní cena 2008
Cena za nejlepší evropský film uvedený v rumunské distribuci v roce 2008
MFF Minsk – film získal druhou hlavní cenu „Stříbrný listopad“ za nejlepší film a herec Martin Huba cenu poroty za nejlepší herecký výkon ve vedlejší roli.
20. MFF Castellón (Španělsko) - hlavní cena „Mořská hvězdice“ za nejlepší film